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Direct RNA測序是一種無需先將RNA分子逆轉錄為互補DNA(cDNA),即可直接對RNA分子進行測序的技術?;贜anopore測序平臺,能夠直接讀取全長轉錄本,避免了傳統RNA測序中需要的反轉錄和PCR擴增步驟,從而減少了測序偏好性和可能引入的偏差。應用于轉錄組分析、RNA修飾研究、疾病診斷和治療等方面。
無需逆轉錄:避免了逆轉錄過程中可能引入的偏差和錯誤,能夠更準確地反映RNA轉錄本的真實情況,尤其是對于低豐度的轉錄本和具有復雜結構的RNA分子,如非編碼RNA、環狀RNA等,其檢測效果更為顯著。
單分子分辨率:可以對單個RNA分子進行測序和分析,能夠捕捉到RNA分子的異質性,如轉錄起始位點的差異、poly(A)尾長度的變化、RNA修飾的動態變化等,有助于深入了解RNA的生物學功能和調控機制。
直接檢測RNA修飾:能夠直接識別和定位RNA分子上的各種修飾位點,如甲基化、假尿嘧啶化等,為研究RNA的表觀轉錄組學提供了有力的工具,有助于揭示RNA修飾在基因表達調控、細胞分化、疾病發生發展等過程中的重要作用。
長讀長測序:可產生較長的測序讀長,能夠跨越整個RNA轉錄本,包括5'UTR、編碼區和3'UTR等,從而獲得全長轉錄本的序列信息,有利于研究基因的可變剪接、融合轉錄本的形成以及復雜的轉錄本異構體,對于解析轉錄組的復雜性和多樣性具有重要意義。
細胞:≥1x106個
動物組織:≥1g
植物組織:≥3g
真核微生物:≥300mg/106
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