IF:6.7/Q1,轉錄組邂逅網絡藥理學,復方高分研究新范式!
題目:西洋參三七丹參顆粒通過AMPK/SIRT1信號通路減緩D-gal誘導的C57BL/6J小鼠衰老
英文名:Xiyangshen Sanqi Danshen granules attenuated D-gal-induced C57BL/6J mouse aging through the AMPK/SIRT1 signaling pathway
雜志:Phytomedicine
影響因子:6.7/Q1
發表時間:2024年11月17日
研究背景:衰老是全球亟待解決的問題,許多慢性疾病也經常伴隨著衰老的出現。西洋參三七丹參顆粒(XSD)具有抗氧化、抗炎和抗疲勞的作用,但其抗衰老作用的機制尚不清楚。
研究思路:本研究通過在D-半乳糖(D-gal)誘導的C57BL/6J小鼠衰老模型中進行轉錄組分析和網絡藥理學分析,闡明了XSD的抗衰老機制和潛在活性成分。從莫里斯水迷宮、被動回避試驗和旋轉棒試驗結果來看,XSD提高了D-gal誘導的衰老小鼠的學習和記憶能力,同時增強了其運動功能。此外,XSD還能顯著提高D-gal小鼠頸總動脈的血管脈搏波速度(PWV)、β-剛度指數和壓力應變彈性系數(EP),降低頸動脈擴張性(CD),并降低P53和8-OHdG的表達水平。轉錄組測序分析發現,AMPK/SIRT1信號通路是XSD減緩衰老的潛在機制。XSD還提高了D-gal誘導的小鼠大腦中Ki67、AMPK、SIRT1和Nrf2核轉位的蛋白水平,同時降低了P21、P53、IL-18、8-OHdG、硝基酪氨酸、COX-2和NF-κBp65核轉位的蛋白水平。服用AMPK抑制劑和SIRT1抑制劑會阻礙XSD的抗衰老作用,表現為8-OHdG、COX-2和NF-κBp65的核轉位升高;Ki67和Nrf2的核轉位降低。網絡藥理學分析表明,XSD的潛在活性成分是槲皮素、山柰酚、丹參酮IIA、異鼠李素、人參皂苷F2和隱丹參酮。
研究結果:
1、XSD的化學成分
圖1顯示了正負信號模式下XSD的典型全離子色譜圖譜。利用mzcloud在線數據庫和本地自建的中藥天然產物mzVault數據庫檢測特征峰。確認陽性結果的標準包括質量偏差小于5ppm、同位素分布一致以及與mzVault參考數據庫的匹配得分超過70分。通過分析,確定了XSD中的210個成分。
圖1
2、XSD可改善D-gal誘導的衰老小鼠的記憶和運動能力
服用XSD10周后,進行了行為測試以驗證XSD的有效性。隨著訓練課程的進行,小鼠的逃逸潛伏期(小鼠找到平臺所需的時間)普遍下降,這表明訓練有效,并預示著第六天的測試可以繼續進行(圖2B)。第六天的測試結果表明,與未經處理的對照組小鼠相比,經D-gal處理的小鼠表現出更短的游泳距離和更少的平臺穿越次數(圖2C-E)。XSD和MT處理增加了D-gal小鼠穿越平臺的次數和在目標象限的游泳距離。此外,XSD處理的D-gal小鼠的被動回避結果也有顯著改善,這表明XSD可以增強D-gal小鼠的記憶力(圖2F-G)。如圖1H所示,旋轉棒實驗結果表明,XSD處理的D-gal小鼠與D-gal處理的小鼠相比,跌倒潛伏期顯著增加。
圖2
3、XSD可延緩D-gal誘導的衰老小鼠頸總動脈的衰老
圖3A-E顯示,與對照組相比,D-gal組小鼠血管的脈搏波速度、β-僵化指數和EP顯著增大,CD顯著減小。XSD能明顯降低D-gal組小鼠血管的脈搏波速度、β-僵化指數和EP,增加D-gal組小鼠的CD。此外,與對照組相比,D-gal組小鼠頸總動脈棕色沉積量明顯增加,表明D-gal組小鼠P53和8-OHdG的表達水平更高,而XSD能明顯降低D-gal誘導小鼠P53和8-OHdG的表達水平(圖3F-I)。
圖3
4、XSD調節的衰老標志物可抑制D-gal誘導的衰老小鼠的氧化損傷和炎癥反應
D-gal組的Ki67水平明顯低于對照組,而D-gal小鼠經XSD處理后,Ki67水平發生逆轉(圖4A-B)。與對照組相比,D-gal組中P21的水平升高,但XSD處理的D-gal組中P21的水平降低(圖4B,D)。然而,XSD處理降低了D-gal處理小鼠的COX-2和IL-18水平(圖4B、C)。總之,XSD增加了Ki67表達,降低了P21表達,抑制了氧化損傷和炎癥反應。
圖4
5、 轉錄組分析
火山圖顯示,與對照組相比,D-gal組有907個基因上調,899個基因下調(圖5a)。分層聚類分析結果表明,某些基因的表達模式在D-gal處理后發生了改變,而這些改變在給藥后被逆轉(圖5B)。KEGG富集分析與"PI3K-Akt信號通路"、"P53信號通路"、"氧化磷酸化"等相關(圖5C-D)。XSD調控的DEGs隨后與104個疾病靶標相關聯(圖5E),KEGG富集分析則富集了與"氧化磷酸化"、"AMPK信號轉導"和"長壽"相關的信號通路(圖5F-G)。此外,還構建了DEGs及其相關疾病靶標的網絡,并用紅色框標出了參與"長壽調節通路"的靶標(圖5H)。網絡中排名前四的靶標在長壽調節通路中用紅色圓圈標出;這些靶標集中在長壽調節通路AMPK/SIRT1軸的下游。因此,推測XSD可能會調節長壽調節通路的AMPK/SIRT1軸,從而減輕D-gal誘導的衰老(圖5J)。
圖5
6、XSD增強了D-gal誘導的衰老小鼠的AMPK/SIRT1信號通路
為了驗證這一假設,在IF、WB和ELISA實驗中研究了XSD對D-gal小鼠體內AMPK、SIRT1及其下游蛋白P53和NF-κBp65的影響(圖6A)。在D-gal處理的小鼠大腦中檢測到AMPK和SIRT1的表達水平明顯下降,而XSD處理則提高了AMPK和SIRT1的水平(圖6B,E)。此外,經D-gal處理的小鼠大腦中的P53含量顯著增加,同時NF-κBp65從細胞質向細胞核的轉位也增加了。與此相反,XSD處理降低了D-gal處理小鼠的P53水平和NF-κBp65的核轉位(圖6B-D)。這些結果表明,在D-gal誘導的衰老小鼠中,XSD激活了AMPK/SIRT1通路。
圖6
7、AMPK和SIRT1抑制劑抑制了XSD對D-gal誘導的小鼠衰老的抗衰老作用
為了驗證XSD的抗衰老機制,應用AMPK抑制劑和SIRT1抑制劑分別抑制AMPK和SIRT1(圖7A)。XSD介導的Ki67水平升高和Nrf2的核轉位受到了明顯抑制(圖7B-C)。這些結果表明,抑制AMPK和SIRT1可抑制XSD在D-gal誘導的小鼠中的抗衰老作用。通過OB和DL對XSD的測定成分進行篩選后,篩選出6個合格化合物,確定了與長壽信號通路中10個靶點相關的316個藥物靶點,并用Cytoscape3.7.1構建和繪制了網絡圖(圖7D)。根據這些發現,推測XSD中具有抗衰老作用的有效成分可能是槲皮素、山柰酚、丹參酮IIA、異鼠李素、人參皂苷F2和隱丹參酮。
圖7
總結:XSD通過增強AMPK/SIRT1信號通路,緩解了D-gal誘導的C57BL/6J小鼠衰老。這項研究為抗衰老提供了潛在藥物,同時也促進了XSD抗衰老作用的應用。文章方法易復現,傲星生物不僅具有豐富的分析經驗、還提供完善的下游驗證、機制研究服務,一對一專屬服務為您排憂解難,助您輕松應對畢業和晉升!