IF:12.4,網絡藥理學+轉錄組+機制實驗,解析隱丹參酮防止腹主動脈瘤形成!
題目:通過隱丹參酮靶向平滑肌細胞Keap1-Nrf2-GSDMD-焦亡軸可防止腹主動脈瘤形成
英文名:Targeting the smooth muscle cell Keap1-Nrf2-GSDMD-pyroptosis axis by cryptotanshinone prevents abdominal aortic aneurysm formation
雜志:THERANOSTICS
影響因子:12.4
發(fā)表時間:2024年10月07
研究背景:腹主動脈瘤(AAA)是一種炎癥性、致命的主動脈疾病,目前缺乏任何有效的藥物。隱丹參酮(CTS)是一種突出且廉價的生物活性物質,來源于丹參Bunge,這是一種眾所周知的草藥,通過其強大的抗炎特性治療心血管疾病。然而,CTS對AAA形成的治療效果仍然未知。
研究思路:為探討CTS對AAA的治療效果,采用多種實驗方法,主要包括AAA小鼠模型建立、實時聚合酶鏈反應(PCR)、RNA測序、蛋白質印跡、免疫共沉淀、掃描/透射電子顯微鏡(SEM/TEM)、酶聯免疫吸附測定(ELISA)、seahorse分析、免疫組化和共聚焦成像。在這項研究中,作者證明CTS抑制了輸注AngII的載脂蛋白E敲除(ApoE-/-)小鼠中AAA的形成。網絡藥理學和轉錄組測序分析的結合表明,血管平滑肌細胞(VSMC)中Keap1-Nrf2通路的激活和程序性細胞死亡的調節(jié)與CTS的抗AAA作用密切相關。利用分子對接,結合細胞熱位移測定(CETSA)和等溫滴定量熱法(ITC),在CTS和Keap1之間的Arg415位點建立了一個特定的結合位點。
研究結果:
1、CTS抑制AngII誘導的ApoE-/- 小鼠AAA形成
使用了AngII誘導的小鼠AAA模型,十二周大的雄性ApoE-/-小鼠在AngII輸注當天每天給予低劑量或高劑量的CTS(CTS-L或CTS-H)或載體(圖1A)。在實驗終點,AngII輸注組的收縮壓高于生理鹽水組,無論是否使用CTS治療都沒有顯著差異(圖1B)。高劑量的CTS顯著提高了小鼠AAA模型中的存活率(圖1C-D)。相比之下,CTS-L組只有46.7%(7/15)的小鼠和CTS-H組只有26.7%(4/15)的小鼠出現了AAA(圖1D)。還觀察到CTS治療后maximum腹主動脈直徑顯著降低(圖1E-F)。
圖1
H&E和EVG染色表明CTS大大減輕了彈性蛋白的損傷和惡化(圖1G-I)。此外,CTS治療導致劑量依賴性相當大且陽性區(qū)域較小(圖1J)。AngII灌注小鼠主動脈中層的VSMCs與生理鹽水對照小鼠相比,α-SMA和SM22α水平顯著下降,而CTS有效地挽救了α-SMA和SM22α的下降(圖1J-L)。CTS處理小鼠主動脈中的MMP活性顯著降低(圖1M-N)。這些結果表明CTS阻礙AAA的形成,并維持血管平滑肌細胞穩(wěn)態(tài)AngII誘導小鼠AAA模型。
2、CTS在體外AAA模型中協調VSMC表型、炎癥、氧化應激和線粒體功能
CTS劑量依賴性地抑制了TNF-α誘導的血管細胞粘附分子-1(VCAM-1)和基質金屬蛋白酶(MMP2、3和9)的蛋白表達,這在RAVSMCs(圖2A)和MAVSMCs中起著關鍵作用。如圖2B所示,CTS以劑量相關的方式增加彈性蛋白表達,同時防止TNF-α-誘導的RAVSMCs和MAVSMCs中SMC收縮表型標志物SM22α和α-SMA表達的減少。通過DHE染色和流式細胞術評估的ROS水平在TNF-α或AngII處理中顯著升高,而CTS有效地抑制了這種升高(圖2C-H)。因此,抗氧化劑超氧化物歧化酶(SOD)水平和ATP水平降低,而在TNF-α暴露的VSMCs和AngII處理的小鼠血清中,氧化應激指標丙二醛(MDA)水平升高,CTS阻止了這種影響(圖2I-L)。CTS處理減少了細胞培養(yǎng)上清液中的LDH釋放(圖2M)。CTS處理后,細胞表現出接近正常的形態(tài),沒有明顯的超微結構損傷(圖2N)。此外,TNF-α處理誘導VSMCs的耗氧率(OCR)和細胞外酸化率(ECAR)顯著增加,而CTS處理有效地逆轉了TNF-α誘導的線粒體功能障礙和糖酵解增加(圖2O-P)。將VSMCs暴露于TNF-α會導致細胞質dsDNA和mtDNA數量的增加,而CTS處理逆轉了這種影響(圖2Q-R)。
總體而言,這些發(fā)現表明CTS抑制VSMC炎癥、ROS產生和線粒體損傷,從而在TNFα誘導的AAA 體外模型中維持VSMC穩(wěn)態(tài)。
圖2
3、網絡藥理學結合RNA-seq分析表明,CTS激活Keap1-Nrf2-HO-1通路并抑制細胞死亡通路
為了繪制AAA中CTS交互目標的全局地圖,使用了網絡藥理學(圖3Aa-b)。在這個集中的網絡中,以黃色標記的十個目標在AAA中至關重要,并且已被證明與AAA的進展密切相關,特別是Keap1-Nrf2-HO-1信號軸(圖3Ac-d)。
圖3
CTS主要富集的途徑集中在炎癥反應和細胞死亡的類別上(圖3B)。火山圖顯示,當暴露于CTS時,由轉錄因子Nrf2調節(jié)的靶基因增加,與其他基因相比,Hmox-1(HO-1的基因名稱)表現出最顯著的上調(圖3C)。熱圖顯示與載體組相比,CTS實驗組中Nrf2靶基因的高轉錄(圖3D)。此外,差異表達基因的KEGG分析表明,CTS對炎癥和細胞死亡途徑的調節(jié)有顯著影響,與網絡藥理學的發(fā)現一致(圖3E)。在GO富集分析中,很明顯CTS對“Keap1-Nrf2途徑”產生了影響,與網絡藥理學的結果一致(圖3F)。
4、CTS激活Keap1-Nrf2-HO-1通路并抑制VSMC中的焦亡通路以預防AAA
根據網絡藥理學和RNA-seq的發(fā)現,CTS治療在體內誘導了AngII灌注小鼠主動脈介質中VSMCs中Nrf2和HO-1的穩(wěn)健蛋白表達(圖4A-B)。進一步分析CTS對體外培養(yǎng)的VSMCs的影響,發(fā)現Keap1蛋白表達減少,Nrf2及其靶蛋白HO-1和NQO1顯著增加(圖4C)。Nrf2蛋白水平在細胞核和細胞質中均有所增加,其中增加在細胞核中更為明顯(圖4D)。免疫熒光染色進一步證實了這一點(圖4E),表明Nrf2通路顯著激活。
圖4
RNA-seq數據顯示,在TNF-α刺激的VSMCs中,Gsdmd的轉錄水平升高,而CTS治療緩解了這種升高(圖5a)。通過蛋白質印跡檢測到焦亡途徑中關鍵靶點的蛋白質水平,包括NLRP3、Cle-Caspase1、N-GSDMD、IL-1β和IL-18,并顯示在AngII注入的小鼠主動脈組織或TNF-α處理的RAVSMCs中顯著增加,同時被CTS抑制(圖5B-E)。此外,IHC證實了小鼠主動脈橫截面中NLRP3、Caspase1和GSDMD的表達(圖5F-G),ELISA測定證實了小鼠血清中IL-1β、IL-18和其他兩種關鍵的AAA相關細胞因子(TNF-α和IL-6)的釋放(圖5H)。最后,用相差顯微鏡和掃描電鏡觀察焦亡的形態(tài)學變化。在相差顯微鏡下,細胞呈現氣球狀形態(tài)。此外,SEM觀察到VSMCs在TNF-α刺激下細胞大小腫脹和細胞膜上形成孔隙的明顯跡象,而CTS治療改善了異常形態(tài)學(圖5I-J)。
圖5
5、CTS直接結合Keap1的Arg415殘基激活Nrf2通路,改善氧化應激和炎癥
使用CETSA、分子對接分析和ITC來確定CTS和Keap1之間是否存在直接接觸。測定表明CTS對增加Keap1的熱穩(wěn)定性有實質性影響,Tm50為11.68°C(圖6A)。此外,ITDRF-CETSA測定提供了進一步的證據,證明了IC50為2μM的CTS對Keap1蛋白的劑量依賴性結合和顯著穩(wěn)定(圖6B)。分子對接分析顯示CTS對Keap1的Arg415(R415)殘基具有highest的親和力(圖6C)。Keap1R415K蛋白與CTS的熱穩(wěn)定性顯著下降,與Keap1WT蛋白相比,Tm50值為7.41°C(圖6D)。CTS對Keap1WT蛋白表現出更高的結合親和力,而對突變的Keap1沒有觀察到明顯的結合(圖6E-F)。此外,Co-IP測定顯示CTS治療顯著降低了Keap1蛋白水平與VSMCs中的Nrf2結合(圖6G)。還觀察到CTS處理后Nrf2的泛素化水平降低(圖6H)。這些發(fā)現表明CTS直接與Keap1中的Arg415殘基相互作用,從而阻礙Keap1和Nrf2之間的結合,阻止Nrf2泛素化和隨后的降解,導致Nrf2逃逸和易位到細胞核以開始細胞保護基因的轉錄。
圖6
DHE染色和流式細胞儀顯示,在轉染Keap1-WT的VSMCs中,CTS處理后ROS水平顯著提高,但在Keap-R415K轉染的細胞中沒有(圖7A-B)。此外,將Keap1R415K轉染VSMCs顯著抑制CTS誘導的Nrf2和HO-1蛋白表達上調(圖7C-D)。此外,Western blot表明,CTS在轉染Keap1WT的VSMCs中具有抗炎和抗焦亡作用,但在Keap1R415K中沒有(圖7C-D)。總之,CTS與Keap1中415位點氨基酸的結合對改善至關重要。
圖7
6、在體外 AAA模型中,抑制Keap1-Nrf2通路可逆轉CTS的保護作用
在ML385存在的情況下,CTS對MMPs(MMP2、3和9)以及VCAM-1蛋白水平的消除被完全消除(圖8A)。觀察到MMPs和AAA相關細胞因子(Il1b、Il6和Ccl2)的mRNA水平的類似結果(圖8B)。此外,ML385部分損害了CTS恢復彈性蛋白和SMC收縮表型標志物(SM22α和α-SMA)蛋白水平的能力(圖8C)。ML385處理也逆轉了CTS介導的抗氧化能力,如使用流式細胞術(圖8D-E)和DHE染色檢測ROS水平所示(圖8F-G)此外,CTS對NLRP3-Cle-Caspase1-N-GSDMD介導的焦亡的抑制作用通過ML385給藥被廢除(圖8H)??傊?,這些結果表明,CTS通過激活Nrf2在體外模型中在AAA中維持VSMC穩(wěn)態(tài)并抑制VSMC焦亡。
圖8
7、VSMC特異性 Nfe2l2 敲低消除了小鼠AAA模型中CTS的保護作用
熒光成像顯示AAV特異性感染主動脈而不是其他器官(圖 9 A)。小鼠主動脈的橫截面顯示GFP在中層中特異性表達(圖 9 B)。此外,western blot分析表明,在AAV2病毒存在的情況下,大腦中Nrf2蛋白的表達是一致的,而主動脈明顯降低(圖 9 C)。將病毒注射到ApoE-/-小鼠中,以建立上述AngII誘導的小鼠AAA模型(圖 9 D)。正如預期的那樣,觀察到CTS有效抑制了AngII注入的ApoE-/- 小鼠的AAA形成。有趣的是,當Nrf2在小鼠VSMC中沉默時,抑制作用減弱,如AAA發(fā)生率增加、存活率降低和腹主動脈maximum直徑增加所示(圖 9 E-H)。此外,組織學評估描述了Nrf2缺陷與CTS治療效果受損之間的直接聯系。這表現為顯著的外膜增厚、彈性蛋白碎裂增加以及主動脈內層內膠原含量的顯著降低(圖 9 I-J)。免疫組織化學分析證實了這些發(fā)現,表明AAV介導的shNfe2l2 有效抑制了CTS誘導的VSMC中Nrf2的穩(wěn)定和激活(圖 9 K)。進一步的免疫熒光研究表明,CTS給藥顯著上調了VSMC中的Nrf2表達。使用AAV-shNfe2l2 阻礙了這種上調,同時導致α-SMA蛋白水平降低(圖 9 L)。通過ELISA檢測細胞因子,包括IL-1β、IL-6、IL-18和TNF-α,結果顯示與AngII輸注小鼠相比,CTS處理的小鼠明顯減少。然而,CTS的治療效果在很大程度上被Nrf2敲低所抵消(圖 9 M)。
圖9
此外,免疫組織化學染色顯示,VSMCs中的Nrf2敲低通過增加炎癥、促進VSMC表型轉換和提高MMP水平來阻斷CTS的治療效果。盡管CTS治療可以通過激活Nrf2介導的通路和彈性蛋白水平來改善AAA,但還是觀察到了這一點(圖 10 A),突出了Nrf2是AAA治療的關鍵治療靶點。Western blot分析進一步證明,Nrf2敲低大大削弱了Nrf2通路的激活以及NLRP3和焦亡通路的抑制(圖 10 B)。綜上所述,這些數據表明CTS通過激活Nrf2介導的抗炎作用和抑制NLRP3-caspase1引發(fā)的細胞焦亡,在治療AAA方面很有希望。
圖10
總結:本文通過網絡藥理學與轉錄組測序、分子對接并結合細胞熱位移測定(CETSA)和等溫滴定量熱法(ITC)等濕實驗,探究隱丹參酮 (CTS)對AAA的治療效果的方式,是個很好的例子。傲星生物深耕生信分析十余載,有豐富的實驗方案、完善的下游驗證、機制研究服務,一對一專屬服務為您排憂解難,助您輕松應對畢業(yè)和晉升!