產(chǎn)品介紹

     轉(zhuǎn)錄組研究是理解生命過程必不可少的工具之一，然而二代RNA-Seq不能準(zhǔn)確得到或組裝出完整轉(zhuǎn)錄本，無(wú)法識(shí)別Isoform、同源基因、超家族基因、等位基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本，使人們難以理解這一生命活動(dòng)更深層次的含義。全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，無(wú)需打斷，基于三代測(cè)序平臺(tái)直接獲取轉(zhuǎn)錄本的5ˊ到3ˊ高質(zhì)量全長(zhǎng)序列。

產(chǎn)品特點(diǎn)

     相比二代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，可準(zhǔn)確鑒定基因的可變剪接、可變多聚腺苷酸化（alternative polyadenylation, APA）、融合基因、基因家族和非編碼RNA等信息。基于nanopore三代測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，還可實(shí)現(xiàn)基因和轉(zhuǎn)錄本表達(dá)水平準(zhǔn)確定量。

分析方法

     首先通過全長(zhǎng)序列識(shí)別、全長(zhǎng)序列polish得到一致性序列和一致性序列去冗余，再進(jìn)行后續(xù)的Isoform、同源基因、基因家族、SSR、可變剪接、lncRNA等分析。

分析內(nèi)容

     轉(zhuǎn)錄本全長(zhǎng)序列統(tǒng)計(jì)、可變剪接分析、轉(zhuǎn)錄本融合發(fā)現(xiàn)、可變多聚腺苷酸化、SSR分析、

     新基因編碼區(qū)序列預(yù)測(cè)、轉(zhuǎn)錄因子分析、LncRNA預(yù)測(cè)、差異表達(dá)基因篩選、差異表達(dá)基因注釋和富集分析、差異表達(dá)基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)、GSEA分析。

分析結(jié)果示例圖