細菌完成圖是對細菌全基因組進行測序后,經過復雜的拼接和組裝,最終得到的完整基因組序列圖譜。它就像是細菌的“基因身份證”,全面且精準地展示了細菌基因組的全部信息。在微生物學研究、醫學診斷、環境微生物監測以及工業微生物應用等眾多領域,細菌完成圖都發揮著關鍵作用。例如,在醫學領域,通過細菌完成圖可以深入了解致病細菌的基因組成,為精準醫療提供依據,有助于開發更有效的抗生素和治療方法。
產品特點
采用先進的第三代測序技術(如PacBio或Nanopore測序)與第二代測序技術(Illumina測序)相結合的方式。第三代測序技術能夠讀取較長的DNA片段,減少拼接過程中的錯誤和間隙,而第二代測序技術可以提供高精度的堿基信息,用于校正第三代測序可能出現的錯誤。這種混合測序策略確保了細菌完成圖的高度準確性,堿基錯誤率可控制在極低水平。
細菌完成圖能夠覆蓋細菌基因組的全部區域,包括染色體、質粒等。無論是基因富集區域還是基因間區,都能在完成圖中得到體現。這使得研究人員能夠全面了解細菌基因組的結構和組成,例如一些位于基因間區的調控元件,對于理解基因的表達調控機制至關重要,而細菌完成圖可以完整地呈現這些信息。
在完成圖的基礎上,提供豐富的基因注釋內容。包括基因的位置、長度、編碼的蛋白質序列、基因功能預測(基于同源比對和功能域分析)、基因所屬的代謝途徑等信息。除了單個細菌基因組的信息,還可以提供與其他相關細菌基因組的比較分析結果。例如,通過計算基因的同源性、共線性,以及基因組島的差異等指標。
(1)非致病性(例:傳染病);
(2)對數期50ml,菌液4000×g離心10min(4°C),棄上清,沉淀用無菌水洗2次后液氮速凍,-80°C保存,干冰送樣;
(3)有明顯主帶,無降解,無RNA、蛋白質等雜質污染;
(4)細菌完成圖:DNA總量≥8μg;
真菌精細圖:DNA總量≥10μg;
科研服務咨詢
公眾號二維碼